Se si hanno più sottodomini che puntano allo stesso dominio principale attraverso delle direttive ServerAlias, è possibile comunque gestire per ciascuno di essi criteri di autenticazione differenti dal dominio principale, volendo anche a livello di file delle password:

<Directory es-percorso-per-la-documentroot>
AuthUserFile percorso-del-file-htpasswd
AuthName “Inserisci utente e password”
AuthType Basic
Require valid-user
SetEnvIf Host sottodominio.example.com richiedi_password
Order Allow,Deny
Allow from all
Deny from env=richiedi_password
Satisfy Any
</Directory>